论文世界上首个花椰菜基因组测序完成是关于本文可作为基因组测序方面的大学硕士与本科毕业论文基因组测序论文开题报告范文和职称论文论文写作参考文献下载。
天津科润农业科技股份有限公司蔬菜研究所花椰菜育种团队完成了世界上第一个花椰菜全基因组测序.
我国是世界上花椰菜种植面积最大、总产量最高的国家.椐2016 年FAO报告,全世界菜花（包括花椰菜与青花菜）种植面积约134.33万hm2,年总产量约2 523.37万t；我国种植面积为约52.01万hm2,年总产量达约1 026.37万t,占世界总面积的38.72%,占世界总产量的40.67%.
本项研究以花椰菜高代纯合优良自交系C-8为测序材料,该材料成熟期80 d左右,生长势强,抗病性好,花球极紧实、洁白、无毛,配合力高,是花椰菜育种中的骨干亲本,目前以C-8为亲本已培育出一系列优良的花椰菜品种.通过三代 pacbio ART测序技术,二代Illumina HiSeq平台共测做到原始数据量115.05 G,测序深度为160.24 X,拼接做到到contig 总长为584.60 Mbp,contig N50 达到2.11 Mbp.对组装版本进行多种方法评估,结果均显示基因组一致性、完整性及准确性均较好.注释结果显示,C-8基因组中将近56.65%的序列为重复元件,包括反转座子（37.97%）、DNA转座子（12.62%）以及一些其他的分类元件（7.24%）.此外,通过与已知 ncRNA 库进行比对或进行结构预测,做到到了一系列花椰菜基因组的ncRNA 信息.花椰菜基因组预测出47 772个蛋白质编码基因,其中46 628个（97.6%）可根据已知蛋白库预测出功能.
花椰菜全基因组测序工作对花椰菜育种及相关分子生物学研究意义重大.基因组蕴涵着一个物种所有的遗传信息,开展全基因组测序对于揭示物种的遗传学特征、重要农艺性状的形成机制、开展靶向性分子育种具有重要科学意义.因此,花椰菜全基因组测序的开展对于揭示花椰菜生长发育性状特别是重要农艺性状的形成机制,挖掘具有重要价值且具有独立知识产权的基因资源,抢占花椰菜基础研究的制高点具有重大科学价值.花椰菜全基因序列的揭示,对于开展花椰菜靶向性分子育种、聚合育种,高效精准的培育花椰菜新品种及创制新种质具有极大的促进作用,它好比绘制了一张花椰菜基因地图,育种工作者可按图索骥,大大缩短育种周期,为培育更高产、抗病、优质新品种奠定基础,对推动我国花椰菜育种水平的整体提升及提高花椰菜育种的国际影响力和竞争力具有不可估量的价值.作为自然界少数以花器官为商品器官的蔬菜作物之一,花椰菜全基因组测序工作的完成,对于揭示花椰菜花球形成机制、探索甘蓝类及芸薹属基因组进化和分化過程等提供重要的遗传依据,也将极大地促进甘蓝类作物和其他芸薹属作物的遗传改良.
（天津科润农业科技股份有限公司蔬菜研究所 供稿）
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参考文献：
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