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关于小麦论文范文 三个小麦防御素基因克隆序列分析相关论文写作参考文献

分类:论文范文 原创主题:小麦论文 更新时间:2024-03-29

三个小麦防御素基因克隆序列分析是关于小麦方面的论文题目、论文提纲、小麦面粉的价格论文开题报告、文献综述、参考文献的相关大学硕士和本科毕业论文。

摘 要:本试验从济麦22幼叶中克隆得到三个小麦防御素基因TaPDF(Triticum aestivum defensin),分别命名为TaPDF32、TaPDF33和TaPDF34(GenBank登录号分别为BT009185、BT009167和BT009022).序列分析发现,三个防御素基因各自含有一个长度为243、249 bp和225 bp的开放阅读框 (open reading frame, ORF),依次编码长度为80、82个和74个氨基酸的蛋白.成熟蛋白的分子量均约为5.5 kD,等电点均大于7,含有8个保守的Cys残基.保守结构域分析发现,TaPDF32含有一个γ-硫堇功能结构域,TaPDF33和TaPDF34均含有一个Knot1功能结构域,两者均是植物防御素的典型结构域,因此这三个TaPDF属于典型的植物防御素蛋白.SWISS-MODEL在线软件分析表明,三个TaPDF的 结构均由三股反平行的β-折叠和一个α-螺旋组成.系统进化分析表明,TaPDF32、TaPDF33的氨基酸序列和玉米、粟米的防御素相似性较高,而TaPDF34和大豆的防御素相似性较高,但均和已经报道的小麦防御素相似性较低,表明TaPDF32、TaPDF33和TaPDF34是小麦三个新的防御素蛋白.荧光定量RT-PCR分析发现,TaPDF32、TaPDF33基因在小麦叶片中表达量最高,种子次之,根中最低;TaPDF34基因在叶、种子和根中的表达量基本相同.

关键词:小麦;植物防御素;基因克隆;序列分析;组织特异性表达

中图分类号:S512.101 文献标识号:A 文章编号:1001-4942(2016)11-0001-08

Abstract Three Triticum aestivum defensin (TaPDF) genes, TaPDF32, TaPDF33 and TaPDF34 (GenBank accession No. BT009185, BT009167 and BT009022), were cloned from the young leaves of Jimai 22 cultivar. Sequence analysis showed that each had an open reading frame of 243, 249 bp and 225 bp, which encoded the proteins with 80, 82 and 74 amino acids respectively. The mature proteins, with the estimated molecular masses of all about 5.5 kD and the isoelectric points all higher than 7, each contained eight conservative cysteine residues. Conserved domain analysis found that TaPDF32 contained a strictly conserved gamma-thionin domain, while TaPDF33 and TaPDF34 each had a Knot1 function domain. Both of the domains are the typical characteristics of plant defensin. Thus, the three TaPDFs all belong to typical plant defensin proteins. Study of the three dimensional structure using SWISS-MODEL showed that all of them contained a triple-stranded anti-parallel β-sheet and an α-helix stabilized by four disulfide bridges. Phylogenetic analysis showed that TaPDF32 and TaPDF33 were close to defensins of Zea mays and Setaria italica, while TaPDF34 was close to Clycine max defensin. But they all owned low similarities with the other reported wheat defensins, which indicated that TaPDF32, TaPDF33 and TaPDF34 were three new wheat defensins. Real-time PCR analysis revealed that TaPDF32 and TaPDF33 genes had the highest expression level in leaves, followed by seeds, and the lowest level in roots. Whereas TaPDF34 expressed basically consistent in all tissues.

Keywords Triticum aestivum; Plant defensin; Gene cloning; Sequence analysis; Tissue-specific expression

植物防御素是植物天然防御系统的重要成员[1,2].和昆虫和动物的抗细菌特性不同,植物防御素具有抵御真菌(如尖孢镰刀菌、大丽轮枝菌、灰葡萄孢菌和白色念珠菌等)感染的特性[1,3,4].此外,植物防御素还受环境胁迫的诱导,如干旱[5,6]、寒冷[7,8]和信号分子(茉莉酸甲酯、乙烯和水杨酸)[9,10]等均可诱导防御素基因表达.植物防御素分子量约为5 kD,由45~50个氨基酸组成[11],其典型的 结构是由一个α-螺旋和三股反平行的β-折叠构成的CSαβ模体结构,以8个保守的半胱氨酸残基形成4个分子内二硫键来稳定其 结构[12,13].大部分植物防御素含有4个二硫键,但是矮牵牛的防御素PhD1和PhD2含有10个半胱氨酸残基,形成5对二硫键[14,15].尽管不同植物防御素的氨基酸序列差异很大,但其 结构高度保守[16].通过对其三维结构进行修饰或替换某个氨基酸可以改善其生物功能或赋予新的生物活性[17].

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参考文献:

1、 香蕉MaTET基因克隆和表达分析 摘 要 采用RACE技术克隆香蕉果实采后成熟相关基因MaTET的全长cDNA,利用生物信息学方法分析MaTET基因及推导蛋白的序列,再利用RT-。

2、 云香水仙NAC基因克隆表达分析 摘 要 从‘云香’水仙转录组文库中筛选出1条NAC基因序列,采用PCR技术克隆得到其cDNA序列。序列分析表明,该NAC基因包含822 bp的开。

3、 花生热激蛋白AhHSP70和热激因子AhHSF基因克隆表达分析 摘要:热激蛋白(heat shock proteins,HSPs)和热激转录因子(heat shock factors HSFs)在植物热胁迫信。

4、 水稻α—NAC基因家族克隆生物信息学分析 摘要:新生多肽结合复合体(Nascent polypeptide-associated complex,NAC)是由d和B两个亚基组成的异二聚体。

5、 洋葱AcPME基因克隆序列分析 摘要:以洋葱花蕾为试材,通过RACE试验获得了AcPME基因的全长cDNA序列,GenBank登录号为JF913196 1。该基因DNA序列包含。

6、 山东栽培豆和野生豆抗裂荚基因SHAT1—5克隆序列分析 摘要:大豆的裂荚性是影响其产量的重要因素之一,因此栽培豆中豆荚开裂特性的遗传学机制成为国内外研究的热点。本研究以山东栽培豆(山宁11、山宁17、。